EN | EU | ES

Análisis de genomas a la investigación de poblaciones y ecosistemas

Desde el análisis de genomas a la investigación de poblaciones y ecosistemas.

Con el reconocimiento emergente de la alimentación de la población mundial y el cambio climático global, el estudio de la biodiversidad es clave para mejorar la productividad y resistencia de plantas y animales, pero también para conservar y proteger la diversidad natural y la riqueza de especies como base de nuestra vida en la Tierra. La biodiversidad es la variación genética natural, el campo de especialización del grupo Genomic Resources. Utilizamos las tecnologías ?ómicas? para comprender la biología y la evolución de los organismos en el contexto de los ecosistemas naturales y antrópicos. Es un área de investigación que requiere la combinación de los datos moleculares con la evolución genética, las señales ambientales y las interacciones entre especies, y que va desde el entendimiento de redes bioquímicas activas hasta poblaciones de especies enteras. Por ello genera colaboraciones con expertos de otras disciplinas (ecología, fisiología, microbiología, bioquímica?). Las actividades programadas para el periodo 2016-21 se agrupan en tres líneas de actuación: (1) GENÓMICA DE POBLACIONES o estudio de la estructura genético-poblacional de especies animales para (a) delimitar poblaciones y estimar su tamaño efectivo a fin de aportar una base científica sólida a la gestión sostenible de las especies y (b) desarrollar herramientas moleculares que identifiquen el origen geográfico-poblacional de una muestra cualquiera, y así evitar el fraude en marcas alimentarias de calidad. Los hitos alcanzados en esta línea han hecho que el grupo sea un referente a nivel internacional. Así, tenemos en marcha múltiples colaboraciones y dos proyectos internacionales. (2) BARRIDO GENÓMICO para el estudio de las bases genéticas de rasgos complejos (rasgos de relevancia económica en la industria agro-ganadera o acuicultura) o de rasgos relacionados con la adaptabilidad de las especies. El objetivo es (a) proporcionar herramientas aplicables en programas de selección asistida por marcadores-MAS- o de selección genómica, y nuevos enfoques biotecnológicos. (b) contribuir a entender la resiliencia de las poblaciones y de los ecosistemas ante el aumento de las presiones ambientales (restricción de territorio, nuevos patógenos o cambio climático). (3) METAGENÓMICA o el estudio de la diversidad taxonómica y funcional microbiana de muestras ambientales mediante secuenciación masiva. El objetivo es a) asistir en la monitorización de la biodiversidad y capacidad funcional de los ecosistemas para posibilitar la detección temprana de perturbaciones tales como la aparición de especies invasoras o las derivadas del impacto antrópico, b) aportar conocimiento básico sobre la resistencia a patógenos y tolerancia al estrés conferida por la comunidad microbiana a plantas y abejas para contribuir en la mejora de su productividad además de preservar su diversidad, c) contribuir al descubrimiento de genes cuyo producto proteico/enzimático sean aplicables en biotecnología y deriven en un producto industrial. Aunque es un área de investigación en crecimiento con un enorme potencial, en la actualidad no hay un grupo de investigación en el País Vasco focalizado en este campo de investigación, ni investigadores formados para éllo. Así, el grupo solicitante decidió implantar esta nueva línea de investigación en la Universidad del País Vasco en el 2012.
En resumen, la investigación de Genomic Resources pretende dar respuesta a varios retos de la bioeconomía europea H2020: seguridad alimentaria, agricultura sostenible, investigación marina y economía de base biológica.
Para finalizar, resaltar que a consecuencia de la formación adquirida en el campo de las ?omicas?, en 2014 incluimos la asignatura ?Marine Genomic Resources? en el Master Mundus of Science MER, y estamos organizando el Máster de doble titulación en Bioinformatics for massive sequencing con la Universidad de Bordeaux.

Lines:

Base genética de la adaptación de la anchoa europea al nicho estuarino. Hacia una anchoa cultivada. (Genómica de Poblaciones y Barrido Genómico)
Estudio genético de las poblaciones de sardina europea, la gran desconocida. (Genómica de Poblaciones)
Estudio genético de la de abeja europea: estructura genética, diagnóstico de subespecies y resistencia a varroa. (Genómica de poblaciones y Barrido Genómico).
Barrido genómico en especies domésticas: en busca de señales de domesticación, selección artificial reciente y selección adaptativa a nichos ecológicos.
Caracterización taxonómica y funcional del microbioma en procesos de vinificación. (Metagenómica)
Adaptación del microbioma de plantas/suelos a factores de estrés: patógenos, cambios de uso y fertilizantes. (Metagenómica)
Estudio bioinformático, evolutivo y comparativo del transcriptoma de más de una decena de especies clupeiformes (anchoas, arenques, sardinas) y scombriformes. (Recurso Genómico)
Construcción de un genoma de referencia eucariota: la anchoa europea. (Recurso Genómico)

Institution: 
University of the Basque Country (UPV/EHU)

Science Field: 
Physical Sciences

RIS3 priorities: 
Biosciences & Health

Keywords: 
Tecnologías "ómicas"; Genómica de Poblaciones; Barrido genómico; metagenómica; Gestión sostenible; Seguridad Alimentaria; Selección asistida por marcadores o genomas; Biotecnología; Monitorización de la biodiversidad; Viticultura

Main Researcher: 
Estonba Rekalde, Andone

Address: 
Facultad Ciencia y Tecnología